南京农业大学生物信息高性能计算平台对外开放服务管理及收费办法
生物信息学中心 2020.9.9
南京农业大学生物信息高性能计算平台是校级公共服务平台,在学校“双一流建设”经费支持下建立,由生物信息学中心及网络与数据中心管理运行。一期建设的高性能计算平台共有38个计算节点,1084个处理器核心,处理器采用Intel Xeon E52690V4,每节点配备256G内存,系统的理论浮点峰值计算性能达到40TFlops,可用存储容量达1300TB。另外,系统还配置2个超大内存的节点,用于超量数据的信息分析。
为了充分发挥计算平台的科研服务和计算能力,引导用户合理、科学地使用计算资源,特制定如下高性能计算平台用户管理办法。
一、服务范围
1、生物信息高性能计算平台向南京农业大学所有具有生物信息计算需求的教师、研究生及研究团队提供服务。在资源允许的情况下,对非生命科学研究人员提供有限计算服务。
2、优先保证对高性能计算需求强烈的用户使用,特别是冲击国际前沿水平、涉及国家重点科研项目研究、涉及重大基础理论研究的相关课题。
二、账户申请
1、在生物信息学中心网站下载打印《南京农业大学生物信息学中心高性能计算平台用户申请表》;
2、如实填写相关信息,签字盖章后将纸质文件交到生物信息学中心办公室(理科南楼F214室);
3、同时将电子版发送到生物信息学中心专用电子邮箱:bic@njau.edu.cn。
4、接到申请表的三个工作日内,以邮件方式通知申请人审批结果。
三、使用规则
用户使用时可获得生物信息学中心相关技术支持。同时,必须严格遵守相关的管理制度。
1、用户应根据实际需要申请计算资源,并严格遵守操作规范,通过SSH方式和统一的管理界面或在登陆节点提交作业和获得结果。严禁直接登陆到计算节点上运行程序,严禁在非计算节点执行任何计算任务。
2、本平台仅用于高性能计算,不可专门用于数据存储,不可在未经允许的情况下对外提供网络服务,占用网络带宽,不可利用高性能计算平台泄露国家机密或从事违法犯罪活动。
3、用户应对自己的作业和数据的安全负责,定期备份或整理数据,防止发生数据损坏、丢失和泄密问题。尤其是涉及知识产权的计算结果,应及时取回、清理。
4、用户不得有偿或无偿转让所申请的账号,也不得借用他人账号使用计算资源。
5、对于利用高性能平台得到的成果,用户在发表科研论文、技术报告或其他形式的成果时,应以适当的方式表明该成果得到南京农业大学生物信息高性能计算平台的支持,从而体现高性能计算平台的贡献,促进平台可持续发展。生物信息学中心根据引用与致谢对用户进行相关奖励。引用范例:
本课题/项目/研究得到南京农业大学生物信息学中心高性能计算平台的支持。或在Acknowledgements中指出:supported by the high-performance computing platform of Bioinformatics Center, Nanjing Agricultural University。如有字数限制,可简化为supported by the Bioinformatics Center of Nanjing Agricultural University。
6、 生物信息学中心有权引用用户成果报告中与高性能计算相关的报告内容。
7、生物信息学中心有权定期根据申请人的资源使用情况和研究成果进行资源调整。
8、用户应及时将使用中存在的问题和建议反馈给生物信息学中心。
9、对违反制度者,中心可根据情节轻重责令其限期改正、给予警告、停止向其提供计算服务,并向所在单位通报。如有严重违规或违法者,将根据国家相应的法律规定进行追究。
四、费用及奖励
1、收费原则
集群收费主要目的为优化资源使用,集群软硬件维护升级,工程师雇佣等,有诸如一.2等情况,或者急需计算资源与较大空间的可以面谈,生物信息中心将根据具体情况鼎力支持。
2、用户按照基本费用+机时及申请硬盘空间进行收费。
校内用户每月基本费用300元,校外用户每月基本费用500元,含1T硬盘空间及CPU机时1000小时;
超出1000小时的部分,按照以下标准进行收费:
超出时长部分 |
CPU机时收费标准(元/CPU核小时) |
<3000 |
0.30 |
3000-20000 |
0.20 |
20000-50000 |
0.10 |
>50000 |
针对一.2重要课题协议减免 |
用户实际使用的机时([用户作业结束时间-实际开始运行时间]*申请的 CPU 核数,排队时间不计算在内)支付相关费用。
用户按照需要申请硬盘空间并支付相关费用。硬盘空间基本收费标准如下表:
额外申请空间大小 |
收费标准(元/年) |
1T |
500 |
5T |
2000 |
10T |
3000 |
50T |
12000 |
>50T |
针对一.2重要课题协议减免 |
3、根据用户致谢成果进行计时及免费空间奖励,奖励规则如下:
致谢成果 |
奖励 |
CNS或者重大原创成果 |
终身免费(空间10T) |
SCI影响因子>20.0 |
30000机时 |
SCI影响因子>10.0 |
10000机时 |
SCI |
3000机时 |
核心期刊 |
3000机时 |
每3个月结算一次(1月1日,4月1日,7月1日与10月1日),根据用户提交的资助成果给予用户奖励。奖励可用于冲抵用户之后的付费排队机时费用。