发布时间：2023-02-20 发布人： 浏览次数：

 1. 提交作业

   平台使用IBM-LSF作为作业调度软件，现已写好作业脚本模板/gss1/Doc/lsf_job.example ，建议cp 到自己目录按照自己实际需求更改

   提交作业脚本命令为：bsub < lsf_job.example

   作业流程，注意这边本地测试作业请ssh compute01 节点测试

 2. LSF脚本参数解释

   -q 接队列名 默认使用normal队列

   -e error文件路径默认为当前目录下以作业id号.err文件

   -o 作业日志文件路径默认为当前目录下以作业id号.out文件

   -n 作业运行需要向LSF申请的核数，目前普通单节点最大为28；big单节点最大为144；特别注意软件本身运行的核数取决于软件本身参数与-n参数无关但需要保持一直

   -R span[hosts=1] 申请的核数只允许在一台节点，非mpi作业不要改动该参数，也可以不写

   -m 指定计算节点提交作业 例：-m compute01 非必要不需要写此参数

 3. 命令提交LSF作业

   bsub -q normal -n 4 "bwa xxx"

 4. LSF脚本结合环境变量文件调用软件

 5. 交互式作业（调试；监控作用）

   bsub -Is  -q  队列名   -m  节点 然后输入命令，ctrl+d 生效；ctrl+c 结束