南京农业大学生物信息高性能计算平台是校级公共服务平台,在学校“双一流建设”经费支持下建立,由前沿交叉研究院生物信息学中心及校网络与数据中心管理运行。一期建设的高性能计算平台共有38个计算节点,1084个处理器核心,处理器采用Intel Xeon E52690V4,每节点配备256G内存,系统的理论浮点峰值计算性能达到40TFlops,可用存储容量达1300TB。另外,系统还配置2个超大内存的节点,用于超量数据的信息分析。
为了充分发挥计算平台的科研服务和计算能力,合理、科学地引导用户使用计算资源,特制定此高性能计算平台服务管理及收费办法。
一、服务范围
1、生物信息高性能计算平台面向南京农业大学所有具有生物信息计算需求的教师、研究生及研究团队提供服务。在资源允许的情况下,对非生命科学研究人员提供有限计算服务。
2、优先保证对高性能计算需求强烈的用户使用,特别是冲击国际前沿水平、涉及国家重点科研项目研究、涉及重大基础理论研究的相关课题组。
二、账户申请
1、在生信中心网站(https://bic.njau.edu.cn)下载打印《南京农业大学生物信息高性能计算平台用户申请表》;
2、如实填写相关信息,经申请人及负责人签字、盖学院章后,请将纸质表格交到生信中心办公室(滨江校区10号楼A519室);
3、同时将申请表word电子版发至生信中心邮箱:bic@njau.edu.cn;
4、接到申请表的三个工作日内,中心将以邮件方式通知申请人审批结果。
三、使用规则
用户使用时可获得生信中心的相关技术支持,同时,必须严格遵守以下规则:
1、用户应根据实际需要申请计算资源,并严格遵守操作规范,通过SSH方式和统一的管理界面或在登陆节点提交作业和获得结果。严禁直接登陆到计算节点上运行程序,严禁在非计算节点执行任何计算任务;
2、本平台仅用于高性能计算,不可专门用于数据存储,不可在未经允许的情况下对外提供网络服务,占用网络带宽,不可利用高性能计算平台泄露国家机密或从事违法犯罪活动;
3、用户应对自己的作业和数据的安全负责,定期备份或整理数据,防止发生数据损坏、丢失和泄密问题。尤其是涉及知识产权的计算结果,应及时取回、清理;
4、用户不得有偿或无偿转让所申请的帐号,也不得借用他人帐号使用计算资源;
5、对于利用高性能平台得到的成果,用户在发表科研论文、技术报告或其他形式的成果时,应以适当的方式表明该成果得到南京农业大学生物信息高性能计算平台的支持,从而体现平台的贡献,促进平台的可持续发展。生信中心将根据引用与致谢对用户进行相关奖励。引用范例:
本课题/项目/研究得到南京农业大学生物信息学中心高性能计算平台的支持。或在Acknowledgements中指出:supported by the high-performance computing platform of Bioinformatics Center, Nanjing Agricultural University。如有字数限制,可简化为supported by the Bioinformatics Center of Nanjing Agricultural University;
6、生信中心有权引用用户成果报告中与高性能计算相关的报告内容;
7、 生信中心有权定期根据申请人的资源使用情况和研究成果进行资源调整;
8、用户应及时将使用中存在的问题和建议反馈给生信中心;
9、对违反制度者,中心可根据情节轻重责令其限期改正、给予警告、停止提供计算服务等,并向所在单位通报。如有严重违规或违法者,将根据国家相应的法律规定进行追究。
四、收费及奖励
1、收费原则:
采用预充值模式,用户可将费用预存入账号,每月末对当月使用情况进行扣费,可随时查看账户余额、及时补充费用,无费用即无法登录账号。
集群收费主要目的为优化资源使用、集群软硬件维护升级、工程师雇佣等,若有如前所述一、2情况,或者急需计算资源与较大空间的情况可以面谈,生信中心将根据具体情况鼎力支持。
2、收费标准,中心按照基本费用+机时+申请硬盘空间进行收费:
(1)校内用户基本费用为300元/月,校外用户基本费用为900元/月,含1T硬盘空间及1500小时CPU机时。
(2)超出1500机时的部分,收费标准为:0.09元/CPU核小时。
按照用户实际使用的机时付费,排队时间不计算在内,即:(用户作业结束时间 - 实际开始运行时间)*申请的 CPU 核数。
(3)超出1T硬盘空间的部分,收费标准如下:
超出1T硬盘空间部分 |
收费标准(元/月*T) |
1-50T |
30 |
50T以上 |
20 |
3、中心根据用户致谢成果进行机时及空间奖励,规则如下:
致谢成果 |
奖励 |
CNS或者重大原创成果 |
终身免费(空间10T) |
SCI影响因子>20.0 |
30000机时 |
SCI影响因子>10.0 |
10000机时 |
SCI |
3000机时 |
核心期刊 |
3000机时 |